Componentes principales en mapeo asociativo

PEÑA MALAVERA, A.; GUTIERREZ, L.; BALZARINI, M.

Journal of Basic and Applied Genetics (BAG)

Sociedad Argentina de Genética

Año: 2014 vol. 25 p. 32 - 32

1852-6233

l mapeo asociativo (o mapeo por desequilibrio de ligamiento) permite encontrar lugares específicos del genoma relacionados con la variación de un carácter fenotípico. Es una práctica difundida en el mejoramiento de especies vegetales ya que no necesita la utilización de poblaciones provenientes de cruzamientos controlados. Sin embargo, se ha detectado que en poblaciones estructuradas genéticamente, el número de falsos positivos en la asociación marcador-carácter puede aumentar significativamente. El análisis de componentes principales constituye una herramienta para identificar la estructura y expresar la misma en un número reducido de componentes principales (CPs). Entonces, estos CPs se pueden incorporar como covariables en el modelo de asociación. Diferentes estrategias de modelado se pueden utilizar para tener en cuenta la estructura genética en el mapeo de asociación. El objetivo de este trabajo fue estimar las tasas de falsos positivos derivados de la aplicación de tres modelos