BALZARINI MONICA GRACIELA
Artículos
Título:
Statistical models for phenotype-genotype association studies in genetically structured populations
Autor/es:
PEÑA MALAVERA ANDREA; GUTIERREZ LUCIA; BALZARINI MÓNICA
Revista:
BAG. Journal of Basic and Applied Genetics
Editorial:
Sociedad Argentina de Genética
Referencias:
Lugar: Balcarce; Año: 2016 vol. 27 p. 49 - 49
Resumen:
l mapeo asociativo (MA) es usado para encontrar regiones específicas del genoma relacionadas con la variación de un carácter fenotípico. Sin embargo, se ha detectado que en poblaciones con estructura genética poblacional (EGP), la cantidad de falsos positivos en la asociación fenotipo-genotipo aumenta. El objetivo de este trabajo fue evaluar el desempeño de modelos de MA que consideran la EGP mediante distintas estrategias, desarrolladas bajo la teoría de los modelos mixtos. Se evaluaron modelos de regresión múltiple fenotipo-genotipo incluyendo las siguientes matrices para modelar EGP: matriz Q (probabilidad de pertenencia de cada individuo a cada subpoblación), matriz P (componentes principales de los datos de marcadores), matriz K o de parentesco genético entre las líneas de la población de mapeo. Las columnas de las matrices Q y P fueron usadas en el modelo de MA como covariables de efecto fijo y alternativamente, como efectos aleatorios. También se evaluaron modelos incluyendo si