Fundamento: Si bien las técnicas de NAT utilizadas en Bancos de Sangre de Argentina han sido validadas por las empresas que las comercializan con estándares internacionales, la evaluación local de la sensibilidad de estas técnicas, aporta información valiosa respecto de la capacidad de las mismas para la detección de cepas virales regionales.
Objetivo: En este trabajo se evaluó la sensibilidad del equipo COBAS AmpliScreen? HIV-1 Test, versión 1.5, ROCHE para la detección del ARN viral en muestras de plasmas de individuos infectados con HIV, utilizando el ensayo de minipooles y el ensayo estándar.
Materiales y Método: Se utilizaron 38 muestras de plasma para el ensayo de minipooles y 25 para el ensayo estándar. Las muestras correspondían a individuos HIV-1 positivos, con cargas virales conocidas realizadas por el ensayo VERSANT® HIV-1 RNA 3.0 (bDNA) de SIEMENS. Las muestras utilizadas para el ensayo de minipooles fueron secuenciadas por el kit de genotipado TRUGENE® HIV-1 y el sistema de secuenciación ADN OpenGene? de SIEMENS y clasificadas como 30 subtipos B y 8 formas recombinantes CRF_12 (recombinantes BF) utilizando ?HIV Drug Resistance Database? (Stanford University).
Se realizaron pooles de 6 muestras (1 HIV-1 positiva y 5 HIV-1 negativas) con cargas virales en el rango de 50 a 169 copias/ml de pool. Para la realización de los ensayos se siguieron estrictamente las indicaciones del fabricante
Resultados: La sensibilidad reportada por el fabricante para el ensayo de minipooles es de 95% para 50 copias de RNA/ml pool (78,4 UI/ml) y para el método estándar 95% para 207 copias de RNA/ml (323,4 UI/ml). Así, para detectar un donante positivo en un pool de 6 muestras de plasma el donante debería tener al menos 301,12 copias de RNA/ml de plasma. Obtuvimos para el ensayo de minipooles una sensibilidad de 93% para los pooles con ≥50 copias de ARN/ml de pool y para el método estándar una sensibilidad de 100% para muestras con ≥207 copias de RNA/ml.
Conclusiones: Los resultados del presente estudio demuestran que el ensayo COBAS AmpliScreen? HIV-1 Test, versión 1.5 (Roche) tiene una alta sensibilidad para detectar RNA de HIV, la sensibilidad encontrada es concordante con lo descrito por el fabricante para el ensayo de minipooles y para el procedimiento estándar. Se detectó el 100 % de los subtipos (B y CRF_12) estudiados, siendo la técnica adecuada para el screnning molecular a nivel regional.