La prostatitis es una patología urológica muy común y de difícil tratamiento que consiste en una inflamación de la próstata. La relación entre esta patología e infertilidad es controvertida. El objetivo de este trabajo fue evaluar el eje hipotálamo hipófiso gonadal, niveles de PSA y parámetros seminales. Se estudiaron 44 pacientes con prostatitis crónica que, en un estudio previo, fueron clasificados según su etiología en subgrupos (Prostatitis crónica infecciosa, autoinmune, no infecciosa-no autoinmune) y 15 controles sanos. El grupo de pacientes con prostatitis crónica autoinmune, en relación al grupo control, presentó valores significativamente disminuidos (p <0.05) de: concentración espermática/ml (55.6 x 106 vs 25.9 x 106), morfología espermática según la Organización Mundial de la Salud (21.4% vs 36.1%.), Criterio estricto (9.0% vs 16.2%) y test hiposmótico (67.2% vs 80.18%). Los parámetros hormonales (FSH, LH, Testosterona) se encontraron dentro de los rangos normales en todos los grupos. Los niveles de PSA se observaron significativamente aumentados en el grupo de pacientes con proceso crónico infeccioso en relación al grupo control (12.2 ng./ml vs 1.11ng./ml). Concluimos que los parámetros seminales se encuentran alterados en pacientes con prostatitis crónica y sería éste el primer trabajo que observa un franco deterioro de la calidad seminal en pacientes con respuesta celular autoinmune anti antígenos prostáticos; teniendo en cuenta que las variaciones seminales no son atribuibles a alteraciones hormonales del eje HHG.