Las bacterias patogénicas resistentes a antibióticos pueden ser erradicadas mediante la inactivación fotodinámica (PDI). En esta metodología, un agente sensibilizador es acumulado preferencialmente por las células microbianas y la irradiación del cultivo con luz visible induce el desarrollo de fotoprocesos que afectan el sistema celular, conduciendo a un daño letal en las bacterias.
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Así, la pérdida de la funcionalidad en la membrana celular y agregación de las macromoléculas en el citoplasma, podría ser la principal causa de inactivación bacteriana. El tratamiento con fotosensibilizadores específicos, hace perder la viabilidad de los microorganismos sin que se corra el riesgo de adaptación de los mismos por mutación o por conjugación, debido a que no posee un blanco específico en el microorganismo. Por otro lado las bacterias tratadas no sufren lisis durante el tratamiento evitando que fragmentos de ADN sean liberados y así transmitir su material genético por procesos como la transformación. De esta manera, PDI se muestra cada vez más como una terapia prometedora para el tratamiento de infecciones microbianas.