Esteartículo presenta una crítica al diseño de las encuestas de innovación basadasen el Manual de Oslo para el sector de Software, a partir de una serie deestudios de caso en empresas de Software Libre y de Código Abierto (Free/Libre Open source Software -FLOSS). El objetivo principalde este trabajo es contribuir a identificar las especificidades de lainnovación en las empresas FLOSS que las encuestas tradicionales de innovaciónusualmente omiten, para mejorar las métricas de la innovación en el Software.Realizamos un análisis cualitativo a través de cinco estudios de caso enempresas FLOSS de Argentina, con el objetivo de dilucidar la naturaleza yparticularidades de sus procesos y resultados de innovación junto a lascaracterísticas y rol de la colaboración con la comunidad en el modelo denegocio y la estrategia de innovación de las firmas.