Mecanismo de fragmentación y fotofragmentación del isómero Hoogsteen del par (Citosina-Guanina)H+: Estudio experimental y teórico en fase gaseosa

CRUZ-ORTIZ, ANDRÉS FELIPE;; JARA TORO, RAFAEL ALEJANDRO; ARANGUREN-ABRATE, JUAN P.; PINO, GUSTAVO A.

Otro; V Reunión GRAFOB 2020; 2020

Universidad Nacional de La Plata

Las interacciones intermoleculares entre las bases del ADN desempeñan un papel fundamentalen la formación y estabilización de la estructura de doble hélice del ADN. En particular, las interacciones por puente de hidrógeno son responsables del reconocimiento molecular entre los pares de bases del ADN, por lo que cada una en su forma canónica interactúa específicamente con su base complementaria, de acuerdo al siguiente esquema: citosina (C) con guanina (G) y adenina (A) con timina (T), formando pares de bases canónicos, formalmente conocidos como pares de Watson-Crick (WC). Una década después de que WC descubrieran la doble hélice del ADN, Hoogsteen (Hoo) encontró un apareamiento distinto al propuesto anteriormente; éste se puede formar entre adenina y timina a pH neutro, y entre citosina y guanina a pHs ácidos ya que una de las dos bases debe encontrarse protonada. La presencia de protones (H+) en el medio favorece la protonación de las bases del ADN, lo que induce la formación de pares de bases no canónicos, responsables de la estabilización de estructuras de orden superior, por ejemplo del tipo tríplex, conocidas formalmente como plegamientos no canónicos. Los triplex estabilizados porapareamiento tipo Hoo están involucrados en el desarrollo de enfermedades como, entre otras, la ataxia de Freidreich.En este contexto, el objetivo de este trabajo es el estudio del mecanismo de fragmentación del isoméro HooH+ del dímero protonado Citosina-Guanina (CGH+). Los iones CGH+ generados mediante una fuente de ionización por electrospray (ESI) fueron posteriormente fragmentados por disociación inducida por colisiones (CID) y disociación inducida por radiación (PID) con un láser UV (266 nm) de alta potencia. Los fragmentos generados CH+ y GH+ fueron aislados en una trampa iónica cuadrupolar de tipo Paul y caracterizados por disociación multifotónica infrarroja (IRMPD). Los espectros observados para los fragmentos varian en función del tipo de fragmentación (CID o PID). Complementariamente se realizaron cálculos a nivel B3LYP/6-311G++(3df,2p) para poder comprender estos distintos mecanismo de fragmentación.