GENTI DE RAIMONDI SUSANA DEL VALLE
Congresos y reuniones científicas
Título:
Estudio de la diversidad microbiana de ambientes acuáticos de la región centro de nuestro país
Autor/es:
REYNA LUCIANA; LINARES MAURICIO; WUNDERLIN DANIEL; GENTI DE RAIMONDI SUSANA
Reunión:
Simposio; I simposio SETAC Ecotoxicología y Contamincación; 2006
Institución organizadora:
SETAC
Resumen:
Los microorganismos comprenden la mayor diversidad biológica del planeta. Se estima que más del 99%
de estos no pueden ser cultivados en el laboratorio. Es por ello, que los métodos de análisis
independientes del cultivo son esenciales para entender la diversidad, estructura e importancia biológica
de la mayoría de ellos. En el presente estudio se utilizaron dos metodologías independientes de cultivo:
PCR-DGGE (denaturing gradient gel electrophoresis) y RISA (ribosomal intergenic spacer region
análisis) a los fines de analizar los diversidad de la comunidad microbiana presente en la cuenca del Río
Primero de Córdoba, Argentina. Las muestras de agua fueron recogidas entre los meses de noviembre de
2005 a setiembre 2006 en diferentes puntos del recorrido del río. El ADN bacteriano se extrajo mediante
procedimientos estándares. Fragmentos de los 16SADN, que incluyen las regiones variables V3-V5
fueron amplificados mediante PCR y analizados por DGGE. Por otro lado, los productos de PCR
amplificados con los primers universales de las eubacterias, que permiten amplificar las secuencias
comprendidas entre las subunidades pequeñas (16S) y grande (23S) de los genes rRNA (RISA), fueron
analizados mediante electroforesis en geles de poliacrilamida.
Los resultados obtenidos muestran cambios en la diversidad microbiana del río a su paso por la ciudad de
Córdoba que se correlaciona con los cambios físico-químicos previamente analizados (demanda biológica
y química de oxígeno, oxígeno disuelto y contenido de amonio, nitrito y nitratos, etc.).
Las bandas de ADN más relevantes presentes en los DGGE y RISA fueron cortadas y eluidas del gel. Dos
de ellas han sido clonadas y los clones obtenidos analizados mediante RFLP (restriction fragment length
polymorphism). Al presente se están analizando la secuencia de nucleótidos de los fragmentos contenidos
en dichos clones a los fines de compararlos con las secuencias depositadas en la bases de datos. Este
trabajo representa el primer análisis metagenómico que se realiza en un ambiente acuático local a los
fines de establecer relaciones filogenéticas de su diversidad microbiana