Resumen:
SCREENING VIRTUAL DOS FAMILIAS DE DERIVADOS NBENCENOSULFONILOS
DE BENZIMIDAZOL COMO INHIBIDORES DE
CRUZIPAINA EN TRIPANOSOMA CRUZI : UNA COMPARACIÓN
Gisele Miana, D. Mariano A. Vera y María Rosa Mazzieri
Dto.de Farmacia, FCQ, UNC, Córdoba, 5000, Argentina, mrmazzie@fcq.unc.edu.ar
CONICET, Dpto. de Química, FCEyN, UNMdP, Mar del Plata, 7600, Argentina.
Introducción
Una quimioteca de N-bencenosulfonilos de heterociclos bioactivos, diseñada y
sintetizada en nuestros laboratorios, ha sido sometida a screening de actividad
antiparasitaria y citotoxicidad1-4. De los primeros 109 compuestos ensayados, 10 de
ellos mostraron IC50 menores a 10 μM frente a Tripanosoma cruzi (Tc). La quimioteca
continua en expansión, por lo que, además de ser sometida a cribados biológicos
permanentes, se ha propuesto llevar a cabo en forma simultánea screening virtuales
frente a diferentes dianas terapéuticas y moleculares relacionadas a la bioquímica del
Tc. La cruzipaina es una enzima clave para el ciclo de vida de este parásito agente
etiológico de la enfermedad de Chagas y ha sido identificada como un potencial blanco
terapéutico para dicha enfermedad.
Materiales y Métodos
Para el screening virtual de nuevos agentes antichagásicos, se seleccionó la
estructura cristalográfica del complejo cisteína proteasa-N-MePip-F-HF-VSF (CPK11777).
Sobre la que se realizó el docking de 16 derivados N-Bencenosulfonilos de
Benzimidazol (N-BSBZD) y de los derivados C2-BSBZD que surgieron
inesperadamente luego de estudios de estabilidad de algunos de los derivados NBSBZD
sintetizados. Las estructuras de los ligandos fueron optimizadas con métodos
de DFT (B3LYP/6-31+G*). Además, utilizando el programa ADT 4.2 se analizó la mejor
pose de ligado del inhibidor, la cual correlaciona con la informada por estudios de
rayos X5.
Resultados
Al realizar una comparación de las poses de ligado y de las constantes de
inhibición (Ki) calculadas para los 16 derivados de cada serie muestran valores con
tres órdenes de magnitud más altos que la de K11777, tomado como referencia
(Ki=9,64nM) como se observa en la siguiente Tabla:
N1-BSBZD
C2-BSBZD
R Energía (kcal/mol) KI (uM)
2,3,5,6-tetrametil -7,25 4,85
4-C(CH3)3 -6,94 8,22
4-COCH3 -6,86 9,39
4- NHCOCH3 -6,79 10,58
4-Br -6,53 16,29
4-Cl -6,37 21,53
R Energía (kcal/mol) KI (uM)
2,3,5,6-tetrametil -6,74 11,44
4-NHCOCH3 -6,61 14,3
4-C(CH3) 3 -6,52 16,72
4-Br -6,40 20,31
4-CH3 -6,39 20,88
4-COCH3 -6,37 21,56
Conclusiones
Debido a los resultados obtenidos al comparar ambas familias podemos concluir
que,
los derivados C2-BSBZD han demostrado tener mejor Ki que los
derivados N-BSBZD,
los derivados C2-BSBZD poseen una interacción adicional de puente
hidrógeno la cruzipaina, ya que ahora tiene el NH de la posición 1 libre,
con respecto al modo de ligado, que involucra contactos con los residuos
Cis25 y His162, se observa algunos ubican el SO, bioisostero de CO, en
una posición similar a la del carbonilo del inhibidor en las cercanías del
sitio, mostrando similitudes y diferencias, dependiendo del tipo de
sustituyente sobre el grupo bencenosulfoamido.
La mejor pose de ligado del derivado 4-NHCOCH3 de la familia N1-
BSBZD ubica el CO de la acetamida en una posición similar a la del
inhibidor peptídico.
Referencias
1- Pagliero, R.J.; Lusvarghi, S.; Pierini, A.B.; Brun, R.; Mazzieri, M.R.; Bioorg. Med.
Chem. 2010, 18, 142-50.
2- Pagliero, R.J.; Pierini, A.B.; Brun, R.; Mazzieri, M.R.; Lett Drug Des Discov. 2010, 7,
461470.
3- Hergert LY, Nieto M, Becerra MC, Albesa I, Mazzieri MR. Lett Drug Des Discov.
2008, 5, 313.
4- Becerra MC, Guiñazú N, Hergert LY, Pellegrini A, Mazzieri MR, Gea S, Albesa I.
Exp. Parasitology 2012, 131, 57-62.
3- Kerr, I.; Lee, J.; Farady, C.; Marion, R.; et al; J. Biol. Chem. 2009, 284,25697.